La especiación de metales pesados del lago Mexicano de Chapala fue estudiada usando extracción secuencial para evaluar su movilidad. La constitución mineralógica de sedimentos fue estudiada mediante XRD. Los resultados muestran Pb y Cr presentes en las fracciones intercambiable y de carbonatos indicando un origen antropogénico. El código de evaluación de riesgo indica bajo riesgo de contaminación a la columna de agua. Los resultados de XRD indican que la mineralogía de sedimentos del lago de Chapala  presenta variación espacial. La presencia de Pb y Cr en fracciones intercambiable y carbonatos sugiere que el control de contaminación por metales pesados, no es efectiva por autoridades correspondientes.